Nad właściwym stosowaniem prawa Unii Europejskiej czuwają sądy. Na poziomie ponadnarodowym są to: Trybunał Sprawiedliwości Unii Europejskiej (TS UE), Sąd (dawny Sąd I Instancji), a także sądy wyspecjalizowane. Do ich zadań należy, m. in., rozpatrywanie skarg wniesionych przeciw instytucjom UE odnośnie legalności wydawanych przez nie aktów prawnych, skarg wniesionych przeciw państwom członkowskim w związku z nie przestrzeganiem przez nie prawa UE czy skarg na zaniechanie działania wymaganego traktatami przez instytucje. Sądy państw członkowskich mogą także zwracać się do sądów UE z pytaniem prejudycjalnym, jeśli mają wątpliwości co do interpretacji prawa UE. Skarga może być również wniesiona przez osobę fizyczną lub prawną, o ile akty wydane przez instytucje dotyczą jej bezpośrednio oraz indywidualnie, są do niej adresowane lub dotyczą jej bezpośrednio i nie wymagają aktów wykonawczych. Rozstrzygnięcia TS UE są ostateczne. W przypadku gdy państwo im się nie podporządkuje Trybunał Sprawiedliwości może nałożyć na nie grzywnę.
